在農(nóng)業(yè)上，植物的病原大部分是微生物，而很多生物農(nóng)藥就是微生物本身或代謝產(chǎn)物。在土壤這個(gè)層面上，微生物的合理利用，是保持生態(tài)平衡，提高肥料利用率，提高作物抗逆性的重要舉措。
二十世紀(jì)六十年代開始中國農(nóng)業(yè)長期施用化肥和化學(xué)農(nóng)藥給人類帶來了糧食增產(chǎn)，但也存在許多隱患：
一、破壞土壤，使土壤有機(jī)含量逐年下降，各類養(yǎng)分比例嚴(yán)重失調(diào)，土壤酸化板結(jié)。
二、農(nóng)作物對化肥的依賴性增強(qiáng)同時(shí)使用量也逐年增加，致使“瓜不甜、果不香、菜無味”重茬病害加重。